国家自然科学基金项目面向高水平基础研究和应用基础研究，是衡量一个单位科研实力的重要指标，同时也是学术界竞争最为激烈的科研项目之一，每年生命科学领域的项目资助率不足20%。国家自然科学基金项目成功获批，充分体现了申请者及其科研团队的学术水平，也是依托单位学科发展的重要观测点。
自2009年建院以来，园艺学院已承担45项国家自然科学基金项目，其中面上项目12项，青年科学基金及NSFC-河南联合基金项目33项。此次学院立项项目数再创新高，是对我院在人才队伍、科研平台等方面建设的肯定，也有助于提升学院科研水平和人才培养质量。
2021年我院获国家自然科学基金资助的项目如下：
| 序号 | 项目名称 | 项目类型 | 项目负责人 | 直接经费（万元） |
| 1 | 西瓜短蔓基因ClDW1介导生长素运输调控株高发育的作用机理研究 | 面上项目 | 杨路明 | 58 |
| 2 | 一个西瓜矮化新基因的图位克隆与功能分析 | 面上项目 | 杨森 | 59 |
| 3 | 感病基因SlDND1负向调控番茄对灰霉菌的抗性发生机理研究 | 面上项目 | 孙凯乐 | 58 |
| 4 | 西瓜ClTFL1基因调控侧枝数量的分子机理研究 | 青年基金 | 豆峻岭 | 24 |
| 5 | 甜瓜果实网纹覆盖度主效基因qNc2.1的克隆及功能研究 | 青年基金 | 王盼乔 | 24 |
| 6 | 锌指蛋白MdZF-HD11调控苹果果实采后软化的分子机制解析 | 青年基金 | 王苗苗 | 24 |
| 7 | ‘蜜脆’苹果LG03中果糖含量的主效遗传调控基因挖掘及分子标记鉴定 | 青年基金 | 王正阳 | 24 |
| 8 | 质子泵基因PpVHA-f参与桃果实酸与非酸性状形成的功能解析 | 青年基金 | 张海朋 | 24 |
| 9 | 转录因子CsNLP1提高黄瓜氮素利用效率的分子机制 | 青年基金 | 李娟起 | 24 |
| 10 | 类钙调蛋白CsCML16调控茶树响应低温胁迫的分子机制 | 青年基金 | 周琼琼 | 24 |
